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2014 源宜基因秋季生物信息數據分析培訓班巡講正式開啟
作者: 來源:源泉宜科 發布于:2014-9-13 14:54:47 點擊量:

 

       源宜基因專注于分子生物學技術服務,經過多年的發展,在文庫構建技術、生物信息數據分析、深度測序技術、生物芯片技術、甲基化檢測技術、SNP檢測技術、miRNA檢測技術、實時定量PCR檢測技術方面形成了深厚的技術儲備,并獨具自身特色,通過優質服務贏得了廣大客戶的廣泛好評。

2014源宜基因秋季巡講     農林專場主題

專題一:生物信息數據分析

平臺的構建9:30-10:30)理論+上機

 

1. Linux在生物信息中的應用

2. 生物信息分析中常用的Linux命令

     用戶權限介紹

     軟連接和硬鏈接介紹

     環境變量配置介紹

3. 生物信息分析平臺的初步建立

4. 生物信息云平臺介紹及使用方法

5.生物信息基本技能

6. Linux Shell編程入門

專題二:轉錄組數據分析解讀

及實例操作11:00-12:30)理論+上機

 

1. 介紹轉錄組數據分析的整體流程:包括de novo轉錄組分析、有基因組reference的轉錄組分析、microRNA分析等。

2. 轉錄組分析經驗交流:包括測序量如何選擇;測序質量如何評估;如何根據自己的實際情況選擇mapping/denovo assembly軟件;如何從轉錄組數據尋找生物學問題。

3. 基于二代RNA-seq的差異基因分析(參照序列):

主要利用tophatcufflinks,cuffdiff以及cummeRbund等工具,實現readsmapping, 轉錄本的重構,轉錄本的表達量計算,差異基因分析以及利用cummeRbund圖形化展示cuffdiff的分析結果。GOKEGG富集等功能分析。

專題三:基因組學數據分析解讀

及實例操作13:30-16:00)理論+上機

 

1. 分析工具介紹

2. 平臺數據介紹

3. 基因組常規分析和深度分析

4. 全基因組/外顯子組測序分析介紹

5. 通過對NGS工具的安裝、配置、運行來熟悉Linux環境下的生物信息分析軟件;

6. 重測序的分析流程;

原始測序數據的質控及過濾估、拼接組裝、SNPCalling等分析過程;FastQCBWASamtools等工具的使用;

 

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2014源宜基因秋季巡講     醫學專場主題

專題一:生物信息在臨床研究中

的應用9:30-12:30理論+上機

 

1. 疾病的特征分類

2. 單基因疾病的研究方法

3. 基于組學的復雜疾病研究

4. 生物信息數據庫在臨床醫學中的應用

專題二:高通量測序在臨床研究中

的案例分析13:30-16:30)理論+上機

 

1. 高通量測序的特點與優勢

2. NGS技術在癌癥基因組研究中的應用

3. NGS技術在癌癥轉錄組研究中的應用

4. 復雜疾病GWAS研究

 

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如需報名,請向轄區技術服務專員索要《報名回執》或者在公司網站頁面點擊下載回執表文件下載,填好表發郵箱service@yqykbiotech.com!謝謝!

 

 

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